Климат района Шацких озер характеризуется как умеренно-континентальный, влажный, с мягкой зимой и нестойкими морозами, частыми оттепелями и нежарким летом, значительными осадками, затяжными весной и осенью. Зима мягкая, лето тёплое. Средняя температура января -4,5С, июля 18,6С. Осадков выпадает 550-600 мм в год. Вегетационный период около 200 дней.